מרכז זלמן שזר הוא בית ההוצאה המוביל בתחום ההיסטוריה של עם ישראל בשפה העברית. ההוצאה לאור פועלת מאז שנת 1973 ומעודדת חוקרים צעירים ובכירים לפרסם את פירות מחקריהם. ההוצאה מגישה לחוקרים, לסטודנטים ולציבור המתעניין את החידושים האחרונים בחקר תולדות העם היהודי.

זאת ועוד, ההוצאה לאור של מרכז זלמן שזר יוזמת פרויקטים מיוחדים המקדמים את המחקר ואת הידע על עברו של העם היהודי בישראל ובתפוצות ועל ההיסטוריה של מדינת ישראל.

מדי שנה בשנה כעשרה ספרים חדשים רואים אור בהוצאת מרכז זלמן שזר. את הספרים כותבים טובי ההיסטוריונים וחוקרי העבר היהודי; הספרים עוסקים במגוון נושאים בתולדות עם ישראל. ההוצאה לאור מפרסמת ספרים מסוגים שונים: מונוגרפיות, ספרי מקורות, קובצי מאמרים, ספרי לימוד לבתי הספר העל־יסודיים ורומנים היסטוריים לבני הנעורים. מרכז זלמן שזר מפרסם גם תרגומים של ספרים חשובים בחקר תולדות עם ישראל שראו אור בשפות אחרות.